Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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