Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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