Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms