Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms