Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms