Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms