Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms