Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITPNAQ00169 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms