Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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