Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms