Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms