Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms