Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRATP43155 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms