Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPGP40121 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPGP40121 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPGP40121 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPGP40121 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPGP40121 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms