Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALDH4A1P30038 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms