Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms