Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms