Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms