Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms