Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC130P13994 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms