Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms