Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms