Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms