Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TOP3BO95985 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms