Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms