Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APAF1O14727 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APAF1O14727 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APAF1O14727 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APAF1O14727 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms