Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E9PBE3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E9PBE3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms