Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms