Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINLQ9Y2I6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms