Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms