Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
L1RE1Q9UN81 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms