Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms