Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms