Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms