Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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