Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM9Q9P0T7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms