Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM8Q9NQV8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms