Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms