Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACKR4Q9NPB9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms