Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms