Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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