Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM79Q9BSE2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms