Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms