Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms