Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC97Q96F63 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms