Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms