Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF128Q8TEB7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms