Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms