Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms