Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGAP9Q5VTM2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms